平成27年度遺伝情報実験センターコンピュータシステム利用者講習会を下記の日程で開催致します。
講習内容は、コンピュータシステムの利用の初歩から、遺伝情報解析ソフトウェア利用法の紹介を実習形式で行います。各回10名の定員となります。受講を希望される方は、下記書類に必要事項をご記入の上、微生物病研究所附属 遺伝情報実験センター ゲノム情報解析分野までお申込み下さい。
なお、講習会当日は共同利用機器室1の利用者の皆様への開放は一時中止とさせていただきます。あしからずご了承下さいますよう、お願い申し上げます。
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記 |
日時 : |
3月24日(木)
3月28日(月)
各回とも午後1時30分〜5時
*各回、同内容です。 |
場所 : |
遺伝情報実験センター 共同利用機器室1(微生物病研究所南館2F)
*微生物病研究所 南館2階へ直接お越し下さい。 |
定員 : |
各回 10名 |
内容 : |
- コンピュータシステムの概要説明とその利用法の実習
- 当センター提供の遺伝情報解析ソフトウェアの説明と実習
*内容は検討中の為、随時変更する可能性があります。
13:30-14:20 |
遺伝情報実験センターコンピューターシステムの概要 |
コンピュータシステム利用に際して知っておきたい事項の説明と利用方法の実習を行います。(参考資料*) |
14:30-15:30 |
解析ソフトウェア実習1 |
以下のソフトウェアの機能の一部を用いて、塩基配列やアミノ酸配列の操作や解析の実習を行います。
- 遺伝情報統合解析環境 GeneWebIII(当センター開発)(マニュアル*)
- マルチプルアライメントエディタ GeneAlign(当センター開発)(マニュアル*)
- 統合配列解析ソフト EMBOSS
- 分子進化解析・系統樹作成ソフト MEGA6(参考資料*)(教材ページ)
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15:40-16:50 |
解析ソフトウェア実習2 |
NGS対応統合解析ソフト CLC Genomics Workbench(CLCbio社製)を使用し、NGSデータのアセンブリやマッピング、SNP解析の実習を行います。(参考資料*)
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16:50-17:00 |
補足・質疑 |
*当日に印刷物を配布するためマニュアル・資料は持参不要です。なお、一部のファイルには学外アクセス不可の制限をかけています。
※時刻は目安であり、実習の進行状況によりずれが生じる場合があります。また、使用ソフトウェアの種類や順番は変更する場合があります。
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提出書類 : |
遺伝情報実験センターコンピュータシステムの利用登録がお済みの方
遺伝情報実験センターコンピュータシステムの利用登録がお済みでない方
- 講習会申込書
- 遺伝情報実験センターコンピュータシステム利用申請書
* 受講日は先着順に受講希望者の方と相談の上決定させて頂きます。
* 受講希望者多数の場合は、各研究室1名を優先してご出席頂く予定です。あしからずご了承下さいますよう、お願い申し上げます。 |
申込書類 : |
* 遺伝情報実験センターのコンピュータシステムの利用登録が必要です。
* 利用登録の申請をされる方は必ず上記利用内規をお読み下さい。 |
問い合わせ先 : |
微生物病研究所附属遺伝情報実験センター ゲノム情報解析分野 事務補佐員 神田
E-mail: kkanda_atmark_gen-info.osaka-u.ac.jp
(_atmark_は @ に置き換えてください)
Tel: 06-6879-8365(内線8365)
*医学部、医学部附属病院、附属図書館・生命科学分館、歯学部、歯学部附属病院、豊中キャンパス、箕面キャンパスからは、(内線171-8365)となりますのでお間違いのないようお願い致します。 |
当日の連絡先 : |
微生物病研究所附属遺伝情報実験センター ゲノム情報解析分野
Tel: 06-6879-8365(内線8365)
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受講申込者数 : |
(2016.3.28 現在)
開催日 |
時間 |
申込人数 |
3/24(木) |
13:30〜17:00 |
終了 |
3/28(月) |
13:30〜17:00 |
終了 |
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平成27年度の利用者講習会は終了いたしました。多数のご参加ありがとうございました。 |